عام 2015، يقف العالم على حافة الدمار. ويكمن أمل البشرية الأخير في أيدي “نيرف” (العصب)، وهي وكالة خاصة، تستعمل الـ“ايفانغيليون” (البشرى أو الخبر السار)، وهي آلات عملاقة قادرة على هزيمة الملائكة الذين يهدفون لتدمير الأرض. يبحث “ايكاري غيندو”، وهو رئيس المنظمة، عن طيارين ملائمين يمكنهم التوافق مع الـ“ايفانغيليون”، لإظهار إمكاناتهم الحقيقية. الموظفون الموهوبون، “كاتسوراغي ميساتو”، رئيسة العمليات التكتيكية، و العالمة “اكاغي ريتسوكو”. يقومان بالمساعدة لتحقيق هذا الهدف وحماية الأرض. بعد لقائه مع والده الذي لم يره منذ سنوات، تتغير حياة “ايكاري شينجي” البالغ من العمر 14 عامًا، بشكل كامل، عندما يتم نقله بعيدًا إلى أعماق “نيرف”، إلى مصيره الجديد مروع. على “شينجي” أن يصبح طيارًا لوحدة “ايفانغيليون 01”، حاملا مصير البشرية على كتفيه.